NextGenAMR — un producto de Vanguard Biotech Systems
Cómo está diseñado para funcionar NextGenAMR
NextGenAMR está diseñado para llevar el genoma de una bacteria dentro de su alcance por un flujo de trabajo controlado, organizar las señales relacionadas con la resistencia, conservar la trazabilidad de cómo se obtuvieron y generar salidas estructuradas para que un profesional las revise junto con otras pruebas y el contexto correspondiente.
En desarrollo · No destinado al uso clínico
En desarrollo. El motor de E. coli se está construyendo y se evaluará internamente conforme a un protocolo especificado de antemano. Se ha redactado un protocolo de validación externa independiente. No se han publicado resultados de rendimiento. No destinado al uso clínico.
Detectar evidencia genómica no es, por sí solo, una interpretación clínica. La ausencia de un marcador conocido no demuestra la sensibilidad. Cualquier salida debe revisarse junto con el contexto clínico y las pruebas aplicables.
Entrada
Entrada (por diseño) — Lecturas de secuenciación del genoma completo (FASTQ pareado) de un único aislado cultivado. No muestras primarias ni metagenómica.
Esta web nunca invita a subir archivos: no envíe a través de ella muestras, secuencias, identificadores ni datos de pacientes.
El motor, etapa a etapa
Un estado por etapa: Construido (I+D interna) · En desarrollo · Diseñado. Ninguna etapa describe un resultado.
- 01Construido (I+D interna)
Adquisición verificada
Lecturas con suma de control verificada.
- 02Construido (I+D interna)
Control de calidad de lecturas
Umbrales versionados con códigos de motivo.
- 03Construido (I+D interna)
Ensamblado de novo
A partir de lecturas filtradas por calidad, con limitación reproducible de la cobertura y sin filtrado previo basado en una referencia.
- 04Construido (I+D interna)
Calidad del ensamblado y especie
Completitud, contaminación y especie; las entradas no admitidas se rechazan o se señalan.
- 05Construido (I+D interna)
Detección de mecanismos
Determinantes conocidos, bases de referencia versionadas.
- 06Construido (I+D interna)
Variables de mecanismo
Tres clases de mecanismo, codificadas por separado.
- 07En desarrollo
Probabilidad de resistencia
Modelos por antibiótico, en desarrollo; criterios de evaluación especificados de antemano.
- 08Diseñado
Incertidumbre y abstención
Diseñadas a nivel de modelo; todavía no validadas.
- 09Diseñado
Informe auditable
Diseñado; a partir de un resultado validado contra su esquema.
Salida y abstención
Salida (por diseño) — Para cada antibiótico del panel predictivo, una probabilidad de resistencia con incertidumbre explícita, o una abstención. Nunca un resultado categórico S/I/R.
Abstención — Una no-respuesta deliberada en lugar de una estimación forzada. Hoy, los controles de calidad y de especie rechazan o señalan las entradas no admitidas; la abstención a nivel de modelo está diseñada y todavía no se ha validado.
Procedencia
Cada lote de procesamiento lleva un registro de una sola escritura de lo que lo produjo. Los paquetes de modelo y los registros de resultado se unirán a la misma cadena cuando existan.
Qué está diseñado para contener un resultado
Qué está diseñado para contener un resultado de NextGenAMR: un veredicto de control de calidad con códigos de motivo, la confirmación de especie, los mecanismos de resistencia detectados, una probabilidad de resistencia con su incertidumbre para cada antibiótico del panel predictivo, o una abstención con su motivo, y la procedencia de cada paso. En esta web no se muestra ningún resultado.
Límites
- NextGenAMR no se presenta como un sistema autónomo de diagnóstico; está diseñado para organizar evidencia genómica y generar salidas revisables por profesionales.
- NextGenAMR no sustituye a las pruebas fenotípicas de sensibilidad antimicrobiana (AST). Los resultados genómicos deben interpretarse junto con el AST, el contexto microbiológico y los procedimientos aplicables.
- NextGenAMR no selecciona tratamientos ni genera recomendaciones terapéuticas autónomas. Las decisiones clínicas siguen siendo de los profesionales cualificados.
- NextGenAMR está en desarrollo y no está destinado al uso clínico. No tiene autorización ni declaración de conformidad para uso diagnóstico clínico: ni marcado CE conforme al Reglamento europeo de diagnóstico in vitro (IVDR, Reglamento (UE) 2017/746) ni autorización de comercialización de la FDA. No se declara certificación ISO 13485 de gestión de la calidad.