NextGenAMR — un producto de Vanguard Biotech Systems
Evidencia genómica revisable para workflows de resistencia antimicrobiana.
NextGenAMR procesa datos WGS soportados de aislados bacterianos, organiza el análisis, conserva la provenance y convierte evidencia, warnings y abstenciones en outputs diseñados para revisión profesional.
Preview controlada · Validación en curso · No sustituye el AST fenotípico ni la decisión clínica autónoma.
De un vistazo
- Qué entra
- La entrada es secuenciación de genoma completo (FASTQ paired-end) de aislados bacterianos cultivados dentro del alcance soportado.
- Qué hace
- Vanguard Biotech Systems desarrolla NextGenAMR, una plataforma de software bioinformático que procesa datos WGS compatibles de aislados bacterianos dentro de su alcance soportado, organiza evidencia genómica relacionada con resistencia antimicrobiana, conserva la trazabilidad de cada ejecución y genera resultados revisables por profesionales. NextGenAMR se encuentra en evaluación controlada y validación en curso. No se presenta como un sistema autónomo de diagnóstico, como sustituto del AST fenotípico ni como una herramienta que seleccione tratamientos.
- Qué sale
- Cada ejecución conserva procedencia y metadatos de ejecución y produce resultados estructurados y auditables para revisión profesional (JSON y PDF).
- Quién lo revisa
- NextGenAMR no se presenta como un sistema autónomo de diagnóstico; organiza evidencia genómica y genera resultados revisables por profesionales.
- En qué estado está
- NextGenAMR es una plataforma funcional en preview controlada. Su validación continúa en curso y no se presenta como un sistema autónomo de diagnóstico ni de decisión terapéutica.
Quién participa
- Usuarios operativos que ejecutan análisis dentro del alcance soportado.
- Una institución que administra o patrocina y gobierna la evaluación.
- Revisores profesionales (microbiología / bioinformática) que interpretan los outputs junto con otras pruebas.
- IT / seguridad / dirección institucional que evalúan gobernanza, seguridad y despliegue.
Entradas y alcance
- WGS — FASTQ paired-endImplementadoDisponible para evaluación
Secuenciación de genoma completo (FASTQ paired-end) de aislados bacterianos cultivados dentro del alcance soportado y versionado. La recepción de archivos para una evaluación se realiza solo por un canal controlado acordado con VBS — nunca por el formulario web.
- Especie operativa
- Escherichia coli
- Panel
- 9
- Versión
- 2026.07.0 · 2026-07-15
El alcance operativo publicado actual es Escherichia coli, con un panel cerrado y específico de especie de 9 antibióticos. NextGenAMR es específico por especie por diseño y está construido para ampliarse; otras especies están en desarrollo interno y todavía no están disponibles.
El alcance está definido y versionado. Los archivos para una evaluación se reciben solo por un canal controlado acordado con VBS. El formulario de contacto nunca admite muestras, secuencias, archivos genómicos, identificadores ni datos de pacientes.
Alcance completo y versión →Del input al output revisable
- 01Recepción controlada de un input soportado
- 02Procesamiento bioinformático y organización de evidencia AMR
- 03Calidad, alcance, warnings, abstención y provenance
- 04Outputs revisables + revisión profesional
Una vista del producto
Demostración generada a partir de datos de una muestra bacteriana real durante pruebas internas con la versión actual de NextGenAMR. El contenido ilustra los outputs del producto y no constituye por sí mismo un resultado de validación clínica ni una recomendación terapéutica.
| Antibiótico | Estado | Evidencia |
|---|---|---|
| Amoxicilina–ácido clavulánico | Resistencia probable | blaTEM-1B |
| Ampicilina | Resistencia probable | blaTEM-1B |
| Ciprofloxacino | Resistencia probable | gyrA S83L · parC S80I |
| Ceftazidima | Susceptibilidad probable | no ESBL markers |
| Gentamicina | Susceptibilidad probable | — |
| Meropenem | Susceptibilidad probable | no carbapenemase |
| Nitrofurantoína | Susceptibilidad probable | — |
| Piperacilina–tazobactam | Susceptibilidad probable | — |
| Trimetoprima–sulfametoxazol | Resistencia probable | sul1 · dfrA17 |
- Genes AMR7
- Mutaciones puntuales3
- Replicones plasmídicos2
- Cobertura media82×
- pipeline · ngamr-core@0.4.2
- db · card-2025.09 · resfinder-2025.10
- operador · lab.ops/41
- inicio · 2026-06-19 09:14 UTC
- Región de baja cobertura marcada para revisión.
- Resultado revisado — sin emisión fuera de alcance.
Qué estás viendo
- 01Input: el WGS bacteriano soportado analizado dentro del alcance publicado.
- 02Evidencia: por antibiótico, una probabilidad calibrada — nunca una categoría S/I/R.
- 03Warnings y abstenciones: se muestran cuando la evidencia o la calidad son insuficientes.
- 04Provenance: cómo se produjo el resultado, conservado y revisable.
- 05El sistema no toma una decisión clínica autónoma.
Salidas
- Resultado estructurado (JSON)ImplementadoDisponible para evaluación
Se genera un resultado estructurado y machine-readable por ejecución. Su visibilidad en la interfaz y disponibilidad de descarga se confirman durante una evaluación.
- Informe PDFImplementadoDisponible para evaluación
Se genera un informe PDF por ejecución para revisión profesional. Su disponibilidad entre versiones y ejecuciones se confirma durante una evaluación.
- Evidencia, warnings y abstencionesImplementadoEn la demostración
Por antibiótico del panel soportado, la salida organiza la evidencia relacionada con resistencia como probabilidad calibrada (nunca una decisión categórica S/I/R), con warnings, y se abstiene cuando la evidencia o la calidad son insuficientes. La abstención es una propiedad de control, no un fallo.
- Provenance de la ejecuciónImplementadoDisponible para evaluación
Cada ejecución conserva su provenance (versiones, bases de datos, metadatos de ejecución) para poder trazar un output hasta cómo se produjo.
Para qué está diseñado
- Consolidar un workflow fragmentado y de múltiples pasos en un proceso gobernado.
- Reproducibilidad, provenance y control de versiones.
- Outputs normalizados y consistentes diseñados para revisión estructurada.
- Auditabilidad de cómo se produjo cada output.
No promete tratamiento más rápido, menor mortalidad, ahorro de costes ni menor carga de trabajo — eso requiere mediciones aprobadas que aún no se han reportado.
Lo que NextGenAMR no hace
- No sustituye el AST fenotípico (antibiograma).
- No toma decisiones clínicas autónomas.
- No prescribe ni selecciona tratamientos.
- La ausencia de un marcador detectado no garantiza susceptibilidad.
- No debe utilizarse fuera del alcance publicado.
- El formulario de contacto no admite muestras, secuencias, archivos, identificadores ni datos de pacientes.
- Una demostración basada en un análisis real no es, por sí sola, una validación clínica concluida.
Seguridad, despliegue e integración
- Control de accesoImplementadoDisponible para evaluación
La plataforma opera con control de acceso sobre un modelo de institución/rol, no con acceso general autoservicio.
- Provenance y traza de auditoríaImplementadoDisponible para evaluación
Las ejecuciones conservan provenance y metadatos de ejecución, apoyando una traza auditable y revisable.
- Separación de entornosImplementadoDisponible para evaluación
Desarrollo, staging y producción se ejecutan en cuentas AWS separadas y aisladas.
- Limitación de tasaImplementadoUso interno
Existe limitación de tasa de peticiones en la capa de plataforma.
- Cloud operado por VBSImplementadoDisponible para evaluación
VBS opera actualmente el producto en su propia infraestructura cloud, adecuada para una evaluación institucional controlada.
- API de la aplicación (interna)ImplementadoUso interno
El producto tiene una API interna que sirve sus interfaces web y móvil. Una API pública o institucional es un asunto distinto, que se trata durante una evaluación.
- Roles institucionalesImplementadoDisponible para evaluación
La plataforma distingue participantes institucionales — usuarios operativos, una institución que administra/patrocina y revisores profesionales — en lugar de una única persona que compra, administra, valida y utiliza el producto.
Solo se muestran controles verificados, con su estado. La autenticación avanzada, otros modelos de despliegue (on-premise / híbrido / gestionado) y las integraciones institucionales (LIMS, SSO, webhooks) no se publican como disponibles — se evalúan durante una revisión de encaje institucional.
Seguridad y despliegue →Validación
NextGenAMR se encuentra en evaluación controlada y validación interna, no clínica. Los resultados de validación no se han publicado y no deben inferirse.
No se han publicado métricas de rendimiento clínico (sensibilidad, especificidad, concordancia categórica, VME/ME, exactitud). La evaluación de rendimiento está en curso.
Evidencia y estado de validación →¿Hay encaje para su organización?
Puede haber encaje si…
- · trabaja con WGS de aislados bacterianos dentro del alcance soportado
- · necesita procesamiento reproducible y trazable
- · quiere outputs revisables para interpretación profesional
- · está dispuesta a realizar una evaluación controlada con revisión profesional
No hay encaje inmediato si necesita…
- · un diagnóstico autónomo o una recomendación terapéutica
- · compatibilidad fuera del alcance publicado
- · acceso general autoservicio sin evaluación
- · cargar datos sensibles a través de la web
Preguntas que hacen las instituciones
¿Las demostraciones son reales?
Demostración generada a partir de datos de una muestra bacteriana real durante pruebas internas con la versión actual de NextGenAMR. El contenido ilustra los outputs del producto y no constituye por sí mismo un resultado de validación clínica ni una recomendación terapéutica.
¿Sustituye al AST?
NextGenAMR no sustituye a las pruebas fenotípicas de sensibilidad antimicrobiana (AST). Los resultados genómicos deben interpretarse junto con el AST, el contexto microbiológico y los procedimientos aplicables.
¿La ausencia de un marcador significa susceptibilidad?
Para cada antibiótico en alcance, la salida del modelo es una estimación de la probabilidad de resistencia calibrada — nunca una categoría susceptible/intermedio/resistente (S/I/R).
¿Cómo se inicia una evaluación?
El alcance está definido y versionado. Los archivos para una evaluación se reciben solo por un canal controlado acordado con VBS. El formulario de contacto nunca admite muestras, secuencias, archivos genómicos, identificadores ni datos de pacientes.
¿Cuál es su postura regulatoria?
Vanguard Biotech Systems no realiza actualmente claims de autorización regulatoria ni de uso clínico autónomo para NextGenAMR. El intended use y la estrategia regulatoria se evaluarán conforme evolucione el producto.